理學(xué)院坐落在清華大學(xué)校園內(nèi)的西北區(qū)。由二十世紀(jì)九十年代新建的理學(xué)院樓（蒙民偉理科館）、生命科學(xué)館和二十世紀(jì)二、三十年代建造的科學(xué)館、化學(xué)館、生物館和氣象臺，組成環(huán)境優(yōu)雅的理學(xué)院理科樓群。 清華大學(xué)理學(xué)院成立于 1929 年 , 當(dāng)今我國眾多知名科學(xué)家、院士、專家和學(xué)者都出自清華大學(xué)理學(xué)院。 1952 年清華理學(xué)院各系被調(diào)整到外校，此后清華理科建設(shè)停滯了相當(dāng)長的一個時期。 1978 年后，根據(jù)國家建設(shè)和科學(xué)發(fā)展的需要 , 清華大學(xué)先后成立了應(yīng)用數(shù)學(xué)系、現(xiàn)代應(yīng)用物理系、化學(xué)系、生物科學(xué)與技術(shù)系四個理科系。經(jīng)國家教委批準(zhǔn)， 1985 年正式恢復(fù)重建清華大學(xué)理學(xué)院 , 聘請中科院院長周光召院士兼任理學(xué)院院長 , 標(biāo)志著清華大學(xué)理科進入一個新的發(fā)展時期。 1999 年應(yīng)用數(shù)學(xué)系和現(xiàn)代應(yīng)用物理系分別改名為數(shù)學(xué)科學(xué)系和物理系。 1997 年 6 月 2 日 成立了諾貝爾物理獎得主 楊振寧 教授為名譽主任的清華大學(xué)高等研究中心， 2002 年 8 月 30 日 成立了著名應(yīng)用數(shù)學(xué) 家林家翹 教授為名譽主任的清華大學(xué)周培源應(yīng)用數(shù)學(xué)研究中心。為創(chuàng)建國際知名的學(xué)術(shù)研究中心，造就杰出的理科人才和學(xué)術(shù)大師，邁出了新的步伐。
在清華大學(xué)行政管理體制的框架下，理學(xué)院院級行政管理屬于虛體建制，下設(shè)四個實體建制的理科系。數(shù)學(xué)科學(xué)系設(shè)置數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)、信息與計算科學(xué)兩個本科專業(yè)，物理系設(shè)置物理學(xué)本科專業(yè)，化學(xué)系設(shè)置化學(xué)本科專業(yè)，生物科學(xué)與技術(shù)系設(shè)置生物科學(xué)本科專業(yè)。數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)均為一級學(xué)科博士和碩士學(xué)位授予點。理學(xué)院現(xiàn)設(shè)有數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)和生物學(xué)四個博士后流動站。
清華大學(xué)理學(xué)院以培養(yǎng) “ 高素質(zhì)、高層次、多樣化、創(chuàng)造性 ” 的理科人才為目標(biāo)。理科本科生的學(xué)制均為四年。強調(diào)對學(xué)生進行扎實的現(xiàn)代數(shù)學(xué)和自然科學(xué)基本訓(xùn)練，同時引導(dǎo)和培養(yǎng)學(xué)生對相關(guān)學(xué)科的興趣，要求他們具有很強的面對高新技術(shù)、工程科學(xué)乃至經(jīng)濟領(lǐng)域新發(fā)展的適應(yīng)能力。一半以上的本科畢業(yè)生可以免試進入碩士學(xué)習(xí)階段或直接攻讀博士學(xué)位。 1997 年以來，學(xué)校還舉辦理科本科生“基礎(chǔ)科學(xué)班”，每年從全國高考生和校內(nèi)剛?cè)雽W(xué)的非理科本科新生中招收 50 名左右對理科特別有興趣的學(xué)子，實施強化數(shù)理基礎(chǔ)的專項教學(xué)計劃，培養(yǎng)有志獻身數(shù)學(xué)和自然科學(xué)事業(yè)的優(yōu)秀人才。 2006 年春季學(xué)期理學(xué)院在讀本科生 1701 人、碩士生 488 人、博士生 555 人，在站博士后 136 人。
理學(xué)院師資力量雄厚，結(jié)構(gòu)合理。截至 2005 年底，在編教職工 300 余人，其中教師 286 人，有中國科學(xué)院院士 11 人，教授或研究員 154 人，副教授或副研究員 102 人，博士生導(dǎo)師 127 人。半數(shù)以上的教師是具有博士學(xué)位的年輕學(xué)者。他們在承擔(dān)面向全校學(xué)生的數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)和生物學(xué)基礎(chǔ)課的教學(xué)以及本系專業(yè)課程教學(xué)的人才培養(yǎng)任務(wù)的同時，還承擔(dān)了大量的國家自然科學(xué)基金、國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃、國家高技術(shù)計劃、國家重點攻關(guān)、中央各部委與全國各省市以及來自國際合作的科研任務(wù)。每年發(fā)表數(shù)百篇學(xué)術(shù)論文和十幾部專譯箸作，獲得幾十項科技專利、教學(xué)和科研成果獎勵。
理學(xué)院擁有高水平的教學(xué)和科研基地，先進的儀器和設(shè)備裝備的實驗室，藏書豐富的圖書資料室。各系均配備多臺巨型工作站和上百臺 PC 計算機，全部實現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)化，直接聯(lián)入清華校園網(wǎng)并可接通國際 INTERNET 互聯(lián)網(wǎng)，師生可以共享各種軟、硬件和信息資源。生物物理為全國重點學(xué)科點。物理學(xué)和生物學(xué)兩個專業(yè)為 “ 國家理科基礎(chǔ)科學(xué)研究和教學(xué)人才培養(yǎng)基地 ” ，數(shù)學(xué)和物理學(xué)為 “ 國家工科基礎(chǔ)課程教學(xué)基地 ” �！吧锬づc膜生物工程實驗室”、“一碳化學(xué)與化工實驗室”和“摩擦化學(xué)實驗室”為國家重點實驗室。“單原子分子測控實驗室”、“生命有機磷化學(xué)實驗室”、“量子信息與測量實驗室“和”蛋白質(zhì)科學(xué)實驗室”為教育部重點實驗室。理科樓群寬敞明亮的教室、現(xiàn)代化的實驗研究室、辦公室，相伴著綠草如茵的周邊環(huán)境，理學(xué)院已成為師生專心求知和潛心研究的理想場所。
理學(xué)院和各系分別與國外許多高校、研究所有廣泛的交流合作。每年來自世界各地的許多知名學(xué)者到我院各系講學(xué)，國外留學(xué)生來我院各系攻讀學(xué)位。我院各系教師頻繁出訪，通過各種渠道建立國際學(xué)術(shù)交流計劃，使我院各系和世界同行保持著密切的聯(lián)系。
隨著社會經(jīng)濟的進步與發(fā)展，人們越來越認識到數(shù)學(xué)和自然科學(xué)在高新技術(shù)和工程科學(xué)乃至經(jīng)濟領(lǐng)域的重要地位，社會對理科人才的需求日益增加。清華大學(xué)理科的畢業(yè)生一直很受用人單位的歡迎。除了大部分本科學(xué)生進入本院各系和清華大學(xué)其它相關(guān)專業(yè)研究生學(xué)習(xí)或出國深造外，他們現(xiàn)在活躍在科研和教學(xué)單位、大中型企業(yè)和政府管理等部門，不少人已成為其中的佼佼者。清華大學(xué)理科已經(jīng)成為有志于數(shù)學(xué)和自然科學(xué)本身和有志攀登世界科學(xué)技術(shù)高峰的青年學(xué)子首選的本科專業(yè)之一。
理學(xué)院師生正在遵從清華大學(xué)創(chuàng)建世界一流大學(xué)的宏偉目標(biāo)，按照理科學(xué)科建設(shè)的規(guī)劃以及理科學(xué)生的培養(yǎng)計劃，發(fā)揚清華理科優(yōu)良的學(xué)術(shù)傳統(tǒng)，依托學(xué)校強大的工科背景，發(fā)揮生源好的優(yōu)勢，努力開拓進取，銳意改革創(chuàng)新，辦出清華理科的特色，不但在科學(xué)前沿，而且在國家建設(shè)的重要領(lǐng)域，作出應(yīng)有的貢獻，迎接世紀(jì)挑戰(zhàn)，再度走向輝煌。